Dostawa systemu sekwencjonowania DNA/RNA drobnoustrojów w technologii długich odczytów

Przedmiotem planowanego zamówienia jest dostawa, instalacja oraz uruchomienie zintegrowanego systemu sekwencjonowania kwasów nukleinowych, przeznaczonego do realizacji zaawansowanych analiz genomowych, metagenomicznych oraz transkryptomicznych, wraz z dedykowanym oprogramowaniem, materiałami startowymi, stacją roboczą, szkoleniem personelu oraz gwarancją producenta.
System umożliwia sekwencjonowanie długich fragmentów DNA i RNA z wysoką wydajnością, prowadzenie równoległych eksperymentów sekwencjonowania oraz generowanie danych w czasie rzeczywistym. Rozwiązanie obejmuje w pełni zintegrowany moduł obliczeniowy klasy laboratoryjnej, umożliwiający lokalne przetwarzanie danych, w tym automatyczną konwersję sygnału pierwotnego do postaci sekwencji nukleotydowych oraz wstępną analizę jakościową wyników, bez konieczności korzystania z zewnętrznej infrastruktury informatycznej.
1. Sekwencjonowanie realizowane na urządzeniu opiera się na bezpośrednim, elektronicznym odczycie sekwencji kwasów nukleinowych na pojedynczej cząsteczce, bez etapu amplifikacji klonalnej. Proces polega na pomiarze zmian sygnału elektrycznego generowanego przez przechodzącą przez nanostrukturalny kanał cząsteczkę DNA lub RNA.
2. Urządzenie fabrycznie nowe, nierekondycjonowane, nieregenerowane,
3. Możliwość jednoczesnego prowadzenia 2 niezależnych eksperymentów sekwencjonowania na osobnych portach.
4. Zdolność generowania do 290 Gb danych z jednej (flow cell) w ciągu 72 godzin.
5. Możliwość sekwencjonowania DNA ligowanego, PCR, cDNA, RNA, sekwencjonowania długich fragmentów, bibliotek NGS oraz kodowania wielu próbek (barcoding).
6. Zainstalowane oprogramowanie do zarządzania sekwencjonowaniem i analizy danych dedykowane dla proponowanego urządzenia.
7. Wymiary urządzenia nie przekraczają 180 mm x 225 mm x 430 mm [+/- 10%].
8. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 24 miesięcy.