UK2LF – Sekvenační platforma nové generace pro analýzy lidského genomu (hardware)

Předmětem plnění veřejné zakázky je dodávka a instalace nového, dosud neužívaného, nerepasovaného,
plně funkčního 1 ks přístroje pro sekvenační analýzu DNA, 1 ks přístroje pro fragmentaci DNA a
3 ks různých serverů (výpočetních stanic).

Předmět plnění spočívá v následujícím plnění:

1 kus přístroje pro „masivně“ paralelní sekvenační analýzu založenou na principu tzv. long-read DNA
sequencing, tedy technologie sekvenování DNA pomocí dlouhých čtení. Toto zařízení bude zkoumat
regiony, nové geny, genetickou variabilitu, nové strukturní varianty, polynukleotidové expanze a
regulační prvky, které spadají do tzv. "dark regions", tedy nedostupné stávajícím technologiím tzv.
krátkých čtení DNA. Musí být použitelný pro výzkum, diagnostiku a léčbu vzácných onemocnění v rámci
Evropských referenčních sítí pro vzácná onemocnění ultravzácných onemocnění a mezinárodní
výzkumné sítě ERDERA.org.

1 kus přístroje pro kontrolovanou fragmentaci DNA na velikost vzorků minimálně v rozmezí 5 až 100
kb, rychlostí minimálně 90 vzorků za 120 minut.

3 kusy související výpočetní techniky tzn. serverů pro zpracování surových dat ze zařízení, server pro
ukládání a zálohování výsledků sekvenování a analýzy dat výpočetní a pracovní stanici pro
bioinformatickou analýzu, optimalizované pro spolupráci s výše uvedenými přístroji to vše dle
zadávací dokumentace VZ.